W skład Urzędu wchodzą następujące komórki organizacyjne:
- Wydział Finansowy,
- Wydział Polityki Rynku Pracy;
- Wydział Pośrednictwa Pracy
- Centrum Informacji i Planowania Kariery Zawodowej
- Filia w Białej Podlaskiej
- Filia w Chełmie
- Filia w Zamościu
- Wydział Badań i Analiz;
- Wydział Organizacyjno-Administracyjny;
- Wydział Funduszu Gwarantowanych Świadczeń Pracowniczych;
- Wydział Naboru i Pomocy Technicznej RPO WL;
- Wydział Wdrażania RPO WL;
- Wydział Realizacji PO WER;
- Wydział Koordynacji i Obsługi finansowej EFS;
- Wydział Kontroli,
- Oddział Kadr;
- Oddział Zamówień Publicznych;
- Oddział Informatyki;
- Oddział Informacji i Promocji
- Samodzielne Stanowisko radca prawny;
- Samodzielne Stanowisko ds. BHP i PPOŻ;
- Inspektor Ochrony Danych.